中新網(wǎng)山西新聞7月9日電 (記者 胡健)近日,記者從國家先進(jìn)計算太原中心獲悉,為支持生物技術(shù)賦能經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展,國家先進(jìn)計算太原中心幫助華大基因在先進(jìn)計算平臺上對第三代測序軟件進(jìn)行移植,構(gòu)建起高效的生物分析計算流程與存儲方案。
國家先進(jìn)計算太原中心(以下簡稱“太原中心”)是由山西省委、省政府推動建設(shè)的信息化基礎(chǔ)設(shè)施。太原中心依托“算力+算法+算據(jù)”綜合體系,成為推動科技進(jìn)步與產(chǎn)業(yè)升級的重要引擎。
生物科學(xué)領(lǐng)域一直對存、算能力有著極高的要求。例如,人體全基因組測序每天生產(chǎn)的數(shù)據(jù)約為1TB-6TB,要分析這些數(shù)據(jù),不僅提交計算任務(wù)數(shù)量多,且單個核心計算任務(wù)時長不定,這就要求計算資源必須具備足夠多的物理核心和存儲空間。
為此,太原中心提供了萬余核心的動態(tài)共享資源及10個以上獨(dú)占節(jié)點(diǎn);在存儲方面,提供了數(shù)百TB的分布式存儲和Gbps級專線。通過動態(tài)節(jié)點(diǎn)與獨(dú)占節(jié)點(diǎn)混合方式,確保在處理大量小核心任務(wù)時仍能維持計算資源的最優(yōu)配置,最高支持并發(fā)作業(yè)可達(dá)5000個。
此外,太原中心通過智能管理平臺整合資源,搭建起統(tǒng)一且便捷的使用界面,并引入腳本、模板及圖形化提交等靈活的作業(yè)提交方式。不僅簡化了用戶操作,也有效解決了軟件管理和使用的難題。(完)